ゲノム解析支援
莫大なデータの解析が必要となるゲノム解析の支援を行い、研究者の方々から大きな信頼をいただいています。
解析だけではなく、データ解析側のSE視点で意見を言うことで、研究者が見落としていた有効な情報の発見にも寄与しています。Natureの論文にも研究支援者のSEとしてウルヴァニアックのエンジニアが名を連ねたこともあります。
微生物や植物からのゲノムの抽出等のいわゆるウェットな実験部分の支援はSEでは難しいですが、いったん電子データになってしまえばSEの独壇場です。研究者と対話をし、どういうサマリや集計をしたいかなど打ち合わせを重ね、ビッグデータを研究者にとって意味のある形に集計・整形あるいはグラフ化し、一緒に研究を進めていくことは、SEとしてこの上ない喜びです。
解析だけではなく、データ解析側のSE視点で意見を言うことで、研究者が見落としていた有効な情報の発見にも寄与しています。Natureの論文にも研究支援者のSEとしてウルヴァニアックのエンジニアが名を連ねたこともあります。
微生物や植物からのゲノムの抽出等のいわゆるウェットな実験部分の支援はSEでは難しいですが、いったん電子データになってしまえばSEの独壇場です。研究者と対話をし、どういうサマリや集計をしたいかなど打ち合わせを重ね、ビッグデータを研究者にとって意味のある形に集計・整形あるいはグラフ化し、一緒に研究を進めていくことは、SEとしてこの上ない喜びです。
支援実績
- 様々な牛のゲノム解析と相同性の調査
- 酒米のゲノム解析と品種の違いに影響する遺伝子の発見の支援
- 鶏ゲノムを利用した、うずらゲノム配列の作成支援
- ねずみのRNAの発現量解析支援
- 稲、大根などのアノテーションデータの視覚化とWeb公開支援
- 様々なゲノム解析ツールの調査とテスト利用
- ビッグデータの解析環境の構築とメンテナンス
- 遺伝子研究所スーパーコンピュータの利用支援
- ネットワークインフラの整備